将研究论文转为 Markdown，就能在笔记中阅读、搜索和引用其文字。在 MD Factory 中添加 PDF，选择输出文件夹，然后点击转换。将原始 PDF 与结果一起保存，以便检查分栏、图片和公式。
先转换一篇论文
- 打开 MD Factory，添加要阅读的 PDF。
- 为转换后的文件选择一个单独的输出文件夹。
- 点击转换，然后打开输出文件夹。
- 在编辑器中打开 Markdown，与 PDF 并排查看。
MD Factory 在 Windows 电脑上转换文档，并使用本机 OCR 识别扫描页面。它会保存 Markdown 文件和导出的图片，不会更改原始 PDF。我们的 PDF 转换指南 介绍了扫描件处理和基本的结果整理方法。
先从一篇有代表性的论文开始。如果资料中既有简单的报告，也有双栏论文，请先各检查一篇，再转换其余文件。
检查分栏衔接处的文字
PDF 保存文字的顺序可能与页面上看到的顺序不同，这份 PDF 文字提取指南介绍了这种情况。即使页面在 PDF 阅读器中显示正常，转为文字后仍可能出现段落顺序错误。
选一个双栏页面，沿着段落从一栏底部读到下一栏顶部。检查图片说明、脚注或页眉是否混入句子。找到文字在 PDF 中的原始位置后，再移动错位的内容。
结合上下文查看图片和公式
移动或复制整个文档文件夹，让图片与 Markdown 保持在一起。检查所需图片是否显示，图注是否对应正确的图片。阅读图表时，请同时打开 PDF，尤其是小号坐标轴标签或图例很重要的时候。
使用公式前，请逐一对照原文。注意下标、上标、希腊字母、减号和单位。如果 Markdown 中的公式不清楚，请查看 PDF 页面，不要根据损坏的文字自行重建。
使用表格中的结果时，请一起核对列标题、行标签、数值和单位。数字本身即使复制正确，从错误的行中取出也会改变含义。
检查参考文献和引用
准备使用某条引用时，请从段落中的编号找到对应参考文献。检查作者、标题，以及 DOI 或来源链接。
对照 PDF 核查引用，包括标点和跨行拆开的单词。对于扫描文字，请仔细检查姓名和符号。无法辨认的段落应在笔记中注明，不要猜测。
将论文加入研究笔记
使用容易识别的文件名，例如第一作者的姓名加简短标题。记录某项发现时，写下论文标题，以及核查过的章节或 PDF 页码。将自己的评论与引用文字分开。
如果使用 AI 智能体比较论文，请提供检查过的 Markdown，并要求注明每项论断的来源。引用和结论仍要亲自与论文核对。我们的 AI 智能体文档准备指南 介绍了如何整理这些文件。